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血液DNA甲基化与冠心病发病率:
一项来自强心研究(SHS)的证据
刘健、柏宝辰、卢亚辉
北京大学人民医院
健心荐语
美洲印第安人的冠心病(CHD)负担很重,需要制定策略来识别风险并实施预防性干预措施。DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰,与CHD和动脉粥样硬化的不同风险相关。而现有研究缺乏种群间的可复制性,甲基化位点(胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤[CpG])的生物学依据、以及差异性甲基化CpG位点(DMPs)之间的复杂相互关联。因此,需要在单一模型中利用大量甲基化位点研究血液DNA甲基化(DNAm)与冠心病事件的相关性。
文章介绍
研究方法
图1:SHS研究数据排除过程流程图
研究结果
表2:具有与冠心病相关的传统风险因素的弹性-网络模型和具有多个CpGs的相同模型
在蛋白质-蛋白质相互作用分析中,每个队列的基因网络差异较大。通过SHS研究中弹性-网络模型鉴定的505个DMPs注释到相关基因共466个,舍去235个非编码 RNA 基因或未连接的节点,生成具有231个节点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图(图2)。连接最多的节点(由SHS、FHS、ARIC-Black和ARIC-White选择)是HDAC4,这是一种组蛋白脱乙酰酶,有强有力的证据表明它通过自噬调节血管炎症。
图2:SHS研究中与冠心病发病率相关的DMPs注释基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络图,随后在4个其他队列中评估
结 论
在这项多队列研究中,研究者发现血液DNA甲基化与冠心病的相关性超出了与心血管疾病相关的传统危险因素,在人群中具有复杂的表观基因组特征。
转载自:公众号“见心论道”